En mayo de 2004 quedó constituida con sede en Badajoz la Fundación Godofredo Ortega Muñoz.

La Fundación tiene como principal órgano de gobierno al Patronato cuya presidencia de honor está a cargo de S. M. el Rey, siendo el presidente de la misma el Consejero de Cultura. Se dedicará a la preservación y difusión del patrimonio documental y artístico del legado del pintor, integrado, además de por gran cantidad documental, por 58 lienzos que han sido depositados en la Fundación por la Consejería de Cultura y donados por los herederos del artista.

Los objetivos, entre otros, son los de perpetuar, proteger y difundir el nombre y la obra del pintor, promover actuaciones de difusión, promoción, información e investigación de la obra y la vida del artista, así como desarrollar programas y actuaciones orientados a promocionar y difundir el arte contemporáneo en general, desarrollando programas, planes, proyectos y actividades orientados a satisfacer los fines anteriormente expuestos.